在做 WesternBlot 时,PVDF 膜用甲醇浸泡的目的?
PVDF 膜用甲醇泡的目的是为了活化 PVDF 膜上面的正电基团,使它更容易跟带负电的蛋白质结 合,做小分子的蛋白转移时多加甲醇也是这个目的。
免疫组化和WesternBlot 可以用同一种抗体吗?
免疫组化时抗体识别的是未经变性处理的抗原决定簇(又称表位),有些表位是线性的,而有的属 于构象型;线性表位不受蛋白变性的影响,天然蛋白和煮后的蛋白都含有;构象型表位由于受蛋白空间 结构限制,煮后变性会消失。如果你所用的抗体识别的是蛋白上连续的几个氨基酸,也就是线性表位, 那么这种抗体可同时用于免疫组化和Western,而如果抗体识别构象形表位,则只能用于免疫组化。
要做磷酸化某因子 WesternBlot,其二抗有何要求?
对二抗无要求,要看你实验条件来选择,一般推荐用HRP 标记的二抗。
WesternBlot 中抗体的可以重复应用吗?
抗体工作溶液一般不主张储存反复使用,但是如抗体比较珍贵,可反复使用2-3 次。稀释 后应在 2-3 天内使用,4 度保存,避免反复冻融。
一抗,二抗的比例是否重要?
比较重要,调整好一抗,二抗的比例,可以去掉部分非特异的本底。
蛋白的上样量有没有什么具体的要求?
上样量要根据实验的要求来定, 如果要求是定量和半定量的WesternBlot 则上样量要均等,如 果只是要定性,则没有太大的关系,尽量多上就行了,但是不要超载。
有什么方法可以提高上样量?
a)可以浓缩样品;增大上样体积来增大上样量;
b)用5 倍的上样缓冲液来稀释变性
问大分子量蛋白200KD,在做 western 要注意什么呢?
做 200kd 蛋白的WesternBlot 时要注意,分离胶最好选择>7%的;剥胶时要小心;转移时间需 要相应延长;要做分子量参照(否则出现杂带不知道如何分析)。
做组织样品的western 的时候,怎样处理样品?
必须进行研磨、匀浆、超声处理,蛋白质溶解度会更好,离心要充分,膜蛋白需用更剧烈的方法抽提,低丰度膜蛋白可能还要分步抽提(超速离心)。还有一点就是组织中的蛋白酶活性更强,需要注意抑 制蛋白酶的活性(加入PMSF)。
问一般一次上样的蛋白总量是多少,跟目的蛋白的表达量有关系吗?
WesternBlot 一般上样 30-100 微克不等,结果跟目的蛋白的丰度、上样量、一二抗的量和孵育 时间都有关系,也与显色时间长短有关。开始摸条件时,为了拿到阳性结果,各个步骤都可以量多一点 时间长一点,当然背景也就出来了。要拿到好的结果,如果抗体好的话比较容易,抗体不好的话就需要 反复地试了,当然有的不适合 WesternBlot 的怎样做也不行。
二抗是生物素化的抗体,三抗是亲和素生物素体系,不知采用这样的方案后,封闭液是否 要作调整,能否再用5%的脱脂奶粉呢?好像有资料说脱脂奶粉会影响亲和素生物素的生成,是 吗?
不能使用脱脂奶粉,因为脱脂奶粉中含生物素,用BSA代替应该好一点.
我所测定的蛋白分子量是 105KD,按理说分离胶应当采用7.5%,但资料却要求分离胶和浓缩胶均 采用11%的配方,不知为何?
上述提到的两种凝胶均可以使用,因为105KD 的蛋白在上述两种胶的线性分辨范围内,但需注意 条带位置。
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