N6-甲基腺苷(m6 A)是真核生物中存在的RNA分子上最常见和最丰富的修饰。m6 A修饰由甲基转移酶复合物胃L3催化,并由m6 A RNA脱甲基酶FTO和ALKBH 5去除,它们以α-酮戊二酸(α-KG)和Fe 2+依赖性方式催化m6 A脱甲基。已知胃L3、FTO和ALKBH 5在许多生物过程中发挥重要作用,从发育和代谢到生育。m6 A占所有RNA碱基甲基化的80%以上,存在于各种物种中。m6 A主要分布在mRNA中,也存在于非编码RNA中,如tRNA、rRNA和snRNA。mRNA转录物中m6 A的相对丰度已显示影响RNA代谢过程,如剪接、核输出、翻译能力和稳定性以及RNA转录。m6 A RNA甲基化酶和去甲基化酶的缺陷可导致m6 A甲基化水平异常,从而导致RNA功能障碍并引起疾病。例如,由于具有FTO突变的患者中FTO活性增加,通过尚未确定的途径,靶mRNA中m6 A的异常低水平有助于肥胖症和相关疾病的发作。RNA上的动态和可逆的化学m6 A修饰也可以作为一种新的具有深远生物学意义的表观遗传标记。因此,更多有用的信息,更好地了解m6 A RNA甲基化水平和分布的RNA转录本可以受益于疾病的诊断和治疗。
原理:
该试剂盒包含从总RNA开始进行成功的m6 A RNA富集所需的所有必要试剂。在反应中,裂解/去除含靶m6 A区域两端的RNA序列,并使用珠结合的m6 A捕获抗体拉下含靶m6 A的片段。然后释放、纯化和洗脱富集的RNA。试剂盒中包括非免疫IgG对照和m6 A阳性对照。这些可用于证明试剂盒的功效和富集RNA定量或生物分析仪步骤的性能。
产品描述
EpiQuik™ CUT RUN m6A RNA富集(MeRIP)试剂盒是一套完整的优化缓冲液和试剂,旨在从低输入RNA中富集含有m6A的RNA片段,并通过PCR鉴定区域特异性m6A,或通过使用Illumina平台或其他方法的下一代测序对全表位转录组m6A进行分析。创新的工作原理、优化的方案和试剂盒的组分允许以最小的非特异性背景水平捕获m6A片段。富集的RNA特别适合于快速构建非条形码化(单重)和条形码化(多重)文库,从而允许以更小的偏倚和高分辨率绘制m6A区域。
产品特点
具有以下特点:
高浓缩:使用RNA裂解酶混合物,在不影响抗体占据的RNA区域的情况下,同时对RNA进行片段化并裂解/去除靶向含m6 A序列两端的任何RNA序列。产生仅与抗m6 A抗体结合的短RNA片段。因此,可以可靠地识别真正的目标m6 A富集区域,并实现高分辨率映射。
低输入:未结合的RNA切割和免疫捕获在同一个单管中进行,这能够最大限度地保护含m6A的靶区域并最大限度地减少样品损失,使输入RNA低至500 ng。
最小背景:在含m6 A的靶序列的两(2)端中切割未结合的RNA序列使得能够最小化MeRIP/测序背景,允许使用<1000万个读取进行数据分析。
快速、简化的程序:从RNA到富集m6A RNA的程序约为2小时30分钟,其中有30分钟的动手时间
非常方便:该试剂盒包含EpiQuik™ CUT RUN m6 A RNA富集试剂盒每个步骤所需的所有组件,足以捕获含m6 A的RNA序列,从而使CUT RUN m6 A RNA富集最方便,结果可靠且一致。