上周我们给大家讲解了一下什么是表观遗传和什么是DNA甲基化, 也给大家推荐了适用于DNA甲基化研究的产品:DNA分离提取试剂盒与甲基化DNA定量检测试剂盒。想必有不少同学很想知道,还有没有其他甲基化DNA研究的试剂盒,因为同学们对DNA甲基化的研究可不仅仅局限于定量的检测。
今天就给大家带来期待的第二波产品。
一、DNA甲基化修饰相关产品
DNA甲基化修饰研究手段——DNA亚硫酸盐转化,使用亚硫酸氢钠将胞嘧啶转化为尿嘧啶,而5-甲基胞嘧啶(5-mC)保持完整。 即未甲基化的胞嘧啶残基被脱氨成尿嘧啶,甲基化的胞嘧啶(5-mC)残基不受影响,这使PCR扩增可将尿嘧啶视为胸腺嘧啶,将5-mC或5-hmC识别为胞嘧啶。 这样便能够区分甲基化和未甲基化的胞嘧啶残基,从而提供有关DNA甲基化区域的单核苷酸分辨率信息。
要成功地进行DNA甲基化研究,必须进行完全转化,并减少通常由于严酷的化学反应而导致的DNA降解量。基于亚硫酸氢盐和亚硫酸氢钠的方法是用于研究DNA甲基化并帮助制备基因组DNA进行基因特异性DNA甲基化分析的常用方法。 亚硫酸氢盐转化后通常是下游应用,在基因特异性基础上分析DNA甲基化的流行下游方法包括亚硫酸氢盐测序,甲基化特异性PCR(MS-PCR)和基于甲基化的微阵列。
整个转换过程中,高质量的DNA是至关重要的,因为转换过程中的酸性物质会破坏DNA。而对于大规模亚硝酸氢盐转化实验,高通量选择对于节省时间和降低成本至关重要。那么如何选择合适的产品呢?小编给大家推荐推荐。
Methylamp DNA Modification Kit Cat #P-1001 | BisulFlash DNA Modification Kit Cat #P-1026 | Methylamp Whole Cell Bisulfite Modification Kit Cat #P-1016 | |
代码名称 | “经典” | “快速” | “直接” |
目的 | 基于化学的DNA亚硫酸氢盐转化 | 基于快速热基的DNA亚硫酸氢盐转化 | 直接从细胞,组织,唾液,尿液或血液中转化 |
关键点 | 1. 兼容Illumina工作流程 2. 最坚固可靠 3. 亚硫酸氢盐测序,NGS和各种MSP的理想选择 | 1. 极快 2. 实时MSP的理想选择 3. 可选的测序方案 | 1. 消除了分离DNA的步骤 2. 非常适合包含少量DNA的样品 |
起始原料 | DNA | DNA | 细胞,组织,血液 |
最低输入量 | 50 pg | 200 pg | 100 细胞, 1 µl 血液 |
操作总时长 | < 2 h | 30 min | < 3 h |
洗脱体积 | 8-20 µl | 10-20 µl | 8-20 µl |
转换效率 | 99.9% | 99.9% | 99.9% |
脱硫/净化 | √ | √ | √ |
回收率 | >75% | >75% | >85% |
转换后DNA片段大小 | 200-2000 bp; Avg. Peak of 800 bp | 100-400 bp; Avg. Peak of 250 bp | 200-2000 bp; Avg. Peak of 800 bp |
形式 | 旋转柱 | 旋转柱 | 旋转柱 |
此外,还有高通量DNA修饰试剂盒,EpiNext高灵敏度亚硫酸氢盐测序试剂盒(Illumina),一步法DNA修饰试剂盒,Methylamp通用甲基化DNA试剂盒,Methylamp全细胞亚硫酸氢盐修饰试剂盒等产品,满足您的各种需求哦,感兴趣的话,请联系小艾吧!
二、甲基化DNA PCR & NGS 分析试剂盒
上面我们了解了DNA甲基化修饰相关的产品,也了解了DNA经过修饰后适用于下游分析:如亚硫酸氢盐测序、甲基化特异性PCR(MS-PCR)和基于甲基化的微阵列。是不是认为找产品太麻烦了?其实不麻烦,因为Epigentek同样有配套产品供大家选择,方便大家的实验哦。
货号 | 产品名称 | 描述 | |
P-1028 | Methylamp MS-qPCR Fast Kit | 1. 热启动DNA聚合酶与优化的缓冲液结合可确保MS-qPCR的特异性和敏感性。 2. 绿色染料无需使用序列特异性探针即可进行DNA检测和分析。 | |
P-1056A | EpiNext High-Sensitivity Bisulfite-Seq Kit (Illumina) | 1. DNA同时被亚硫酸氢盐转化并在亚硫酸氢盐过程中片段化为适当的长度。 2. 然后将单链形式的经亚硫酸氢盐处理的DNA同时转换为dsDNA,并进行衔接子连接。 | 1. 选择片段的大小,并用MQ珠进行纯化,从而可以快速,精确地选择DNA的大小。 2. 然后使用高保真PCR混合物扩增大小选择的DNA片段,从而确保从最小量的起始原料中获得最大产量,并以低错误率和最小偏差提供高度准确的文库DNA扩增。 |
P-1055 | EpiNext Post-Bisulfite DNA Library Preparation Kit (Illumina) | 1. 将经过亚硫酸氢盐处理的DNA(单链形式)转换为双链DNA,并直接用于与BisDNA特异性衔接子连接,这对于扩增和测序是必不可少的 | |
p-1051 | EpiNext DNA Library Preparation Kit (Illumina) | 1. 首先将DNA片段化为合适的大小(约300 bp的峰大小)。 进行DNA片段的末端修复,并在每条链的3'末端添加一个A突出端。 2. 然后将衔接子连接至末端修复/ dA尾部DNA片段的两端,以进行扩增和测序 |
想了解更多,请咨询小艾哟~~
三、甲基化DNA免疫沉淀
甲基化DNA免疫沉淀(meDIP)是一种基于抗体的大规模技术,用于富集和捕获甲基化DNA片段,可用于在基因组范围内进行基因特异性DNA甲基化研究。 遵循meDIP方法,可以使用多种下游应用程序分析DNA甲基化,包括meDIP-PCR,meDIP-ChIP和meDIP测序。
Methylamp甲基化DNA捕获(MeDIP)试剂盒 Cat #P-1015 | EpiQuik羟甲基化DNA免疫沉淀(hMeDIP)试剂盒 Cat #P-1038 | EpiQuik MeDIP Ultra KitCat #P-1052 | EpiQuik甲基化DNA免疫沉淀试剂盒 cat#P-2019 | EpiQuik组织甲基化DNA免疫沉淀试剂盒 cat#P-2020 | |
目的 | 富集并捕获甲基化的DNA片段 | 富集并捕获羟甲基化的DNA片段 | 从低起始输入中富集并捕获甲基化的DNA片段 | 直接从细胞裂解物中富集并捕获甲基化的DNA片段 | 直接从组织中富集并捕获甲基化的DNA片段 |
关键点 | 1. PCR和微阵列的理想选择 2.兼容Illumina工作流程 | 1. 与下游工作流程兼容,包括hMeDIP-PCR和hMeDIP-chip | 1. MeDIP-Seq的理想选择 2.兼容Illumina 3. 工作流程 最敏感和最具体 | 1. 通过直接从细胞中免疫沉淀meDNA片段2. 消除了DNA分离步骤 | 1. 通过直接从组织中免疫沉淀meDNA片段2. 消除了DNA分离步骤 |
起始原料 | DNA | DNA | DNA | 细胞 | 组织 |
最低输入量 | 0.2-1 µg | 0.1 µg | 50 ng DNA (10,000 cells) | 100,000 cells | 10mg |
操作总时长 | < 3 hours | < 3 hours | < 3 hours | < 4 hours | <3.5h |
富集效率 | > 98% | > 99% | > 99% | > 95% | > 95% |
转换效率 | 99.9% | 99.9% | 99.9% | 99.9% | 99.9% |
包含高度特异性的抗体 | √ | √ | √ | √ | √ |
包括DNA纯化柱 | √ | √ | √ | √ | |
容器形式 | 96孔板 | 96孔板 | 96孔板 | 96孔板 | 96孔板 |
我们来看看富集的效果,系列图分别对应p-1015,p-1038,p-1052
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四、DNA甲基化抗体
具有良好特征和高度验证的DNA甲基化抗体和DNA去甲基化抗体可能有助于提高研究人员对DNA甲基化及其在疾病、细胞周期调控和胚胎发育中的作用的理解。Epigentek DNA甲基化抗体可适用于多种实验,同时有各种规格的抗体供大家选择。
货号 | 产品名称 | 适用实验类型 | 反应性 | 形式 |
A-1018 | 5-Hydroxymethylcytosine (5-hmC) Monoclonal Antibody [HMC/4D9] | DB, ELISA, hMeDIP, IF, IHC | Broad Range | IgG1 |
A-1014 | 5-Methylcytosine (5-mC) Monoclonal Antibody [33D3] | DB, ELISA, IF, IHC, IP, MeDIP | Broad Range | IgG1 |
A-1001 | DNMT1 Monoclonal Antibody [60B1220.1] | ELISA, IF, IP, WB | Human, Mouse | IgG1 |
A-1002 | DNMT2 Polyclonal Antibody | IHC, WB | Human, Mouse | IgG |
以上就是今天为大家推荐的所有DNA甲基化方面的产品了,预知更多产品,可咨询小艾~~
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