适当使用各种糖苷酶可以确定唾液酸化(仅使用神经氨酸酶)以及N-连接糖链(仅使用PNGase F)和O-连接糖链(使用神经氨酸酶、β-半乳糖苷酶、O-糖苷酶和β-N-乙酰氨基葡萄糖苷酶)的特定存在。另外,QA-Bio在DeGlycoMx试剂盒(KE-DGMX)中提供了一种20微升瓶中预混合的酶溶液。
艾美捷QA-Bio-酶促碳水化合物释放试剂盒包含以下每种酶20微升:
PNGase F(脑膜败血黄杆菌)
O-糖苷酶(肺炎链球菌)
神经氨酸酶(尿素杆菌)
β-半乳糖苷酶(肺炎链球菌)
β-N-乙酰氨基葡萄糖苷酶(肺炎链球菌)
其他提供的试剂:
反应缓冲液
变性溶液
Triton X
牛血清白蛋白(对照)
QA-Bio-酶促碳水化合物释放试剂盒特异性:
酶促CarboRelease试剂盒将去除糖蛋白上的糖基,从糖蛋白中移除所有N-连接的寡糖和许多O-连接的寡糖。使用酶PNGase F去除N-连接(天冬酰胺连接的)。此外,所有丝氨酸或苏氨酸连接的(O-连接)Gal-(b1-3)-GalNAc-(a1)和所有唾液酸替代的Gal-(b1-3)-GalNAc-(a1)将使用神经氨酸酶和O-糖苷酶的组合去除。添加β-半乳糖苷酶和葡糖胺苷酶将有助于较大O-连接结构的去糖基化。
QA-Bio-酶促碳水化合物释放试剂盒容量:
协议中推荐的酶量足以在给定时间内去除大约100微克的平均糖蛋白的糖基。PNGase F裂解通常是限速反应,因为即使是在糖蛋白变性后,一些空间位阻的N-连接残基的去除也很慢。由于所有酶在反应条件下几天内都保持活性,如果延长孵化时间,可以去除更多的糖蛋白。相反,如果正在裂解的糖蛋白量远少于100微克,则无需使用推荐的酶量。这些酶可以稀释到1X反应缓冲液7中。它们在4°C稀释状态下保持稳定。
牛血清白蛋白对照蛋白:
牛血清白蛋白含有唾液酸化的N-和O-连接的寡糖13。
注意:市售的Fetuin制剂含有将最终降解蛋白质的蛋白酶。Fetuin对照已经经过90°C加热10分钟以灭活蛋白酶。Fetuin溶液可以储存在4°C。
变性协议:
在Eppendorf管中,将100微克或更少的糖蛋白溶解在30微升去离子水中。
添加10微升5X反应缓冲液7和2.5微升变性溶液。轻轻混合。
在100°C下加热5分钟。 注意:一些蛋白质可能在与SDS加热时沉淀。在这种情况下,省略热处理,添加酶后将孵化时间延长至24小时。
冷却至室温。添加2.5微升Triton X-100溶液。轻轻混合。 注意:未添加Triton X-100可能导致一些酶活性降低。
添加每种酶1微升。
在37°C下孵化3小时。
按选择的方法进行分析。
或者,可以单独或顺序添加酶,以确定糖蛋白上存在的糖链类型。
非变性协议:
在Eppendorf管中,将100微克或更少的糖蛋白溶解在35微升去离子水中。
添加10微升5X反应缓冲液7。
添加每种酶1微升。
在37°C下孵化24小时。
应使用变性协议进行去糖基化,以提供完全去糖基化蛋白的凝胶标准。然后,可以将原生蛋白的位置与此标准进行比较,以判断去糖基化的程度。
艾美捷科技是QA-Bio的中国代理商,为科研工作者提供优质的产品与服务。
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