PROGEN-检测病毒衣壳蛋白VP1、VP2和VP3检测方案

PROGEN的AAV衣壳蛋白抗体识别病毒衣壳蛋白VP1、VP2和VP3的线性表位。AAV衣壳蛋白的高度序列相似性使得跨血清型的蛋白质易于检测。

图1显示了三种衣壳蛋白和相应的抗体结合位点。由于所有VP蛋白都由相同的阅读框编码，由于使用了交替的起始密码子和交替的剪接，它们仅在N端区域不同。结合C末端部分的抗体，如B1，能够结合所有衣壳蛋白，而像A1这样的抗体只能结合VP1，A69只能与VP1和VP2结合。

衣壳蛋白抗体可用于蛋白质印迹分析，以检测VP1、VP2和VP3的表达水平，以及使用色谱、免疫沉淀或免疫荧光进行蛋白质定位研究或蛋白质-蛋白质相互作用。

艾美捷PROGEN-衣壳蛋白抗体结合位点和反应性：

针对AAV2衣壳蛋白在小鼠体内产生的衣壳蛋白抗体，适用于所有检测变性VP蛋白线性表位的应用，如西方墨点分析（Western blot分析）。

Serotype Antibody Residues* Binding Site

AAV2 A1 123-KRVLEPLGL-131 Binding site is located at the N-terminus of the VP1 protein. Detection of VP1 only.

AAV2 A69 171-LNFGQTGDADSV-182 Binding site is located at the N-terminus of the VP2 protein. Detection of VP1 and VP2.

AAV2 B1 726-IGTRYLTR-733 Binding site is located at the C-terminus common to all three VP proteins. Detection of VP1, VP2 and VP3.

*氨基酸位置与VP1序列有关。

表位作图实验（Wobus等人，2000）确定aa123至aa131（N-末端；）是单克隆A1抗体的特异性结合区。

Wobus，C.E.等人。抗腺相关病毒2型（AAV-2）衣壳的单克隆抗体：参与AAV-2细胞相互作用和AAV-2感染中和的衣壳结构域的表位定位和鉴定。J.Virol。74, 9281–93 (2000).

交叉反应性：

Antibody AAV1 AAV2 AAV3 AAV4 AAV5 AAV6 AAV7 AAV8 AAV9 AAVrh10 AAV11 AAV12 AAVDJ

A1 x x x   x x x x x   x x x

A69   x         na       na na x

B1 x x x   x x x x x x     x

VP51 na x na na x na na na na na na na na

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x-反应性

na-未分析

空场-无反应性

A1

与所有常见血清型AAV1-12的VP1蛋白发生反应。在免疫沉淀中，偶尔可以看到与非AAV衍生蛋白的反应。

B1

由于来自不同AAV的VP蛋白序列高度相似，B1抗体显示出与大多数测试过的AAV血清型的高交叉反应性。

使用AFDyes：

使用AFDye?标记的抗体，您可以在不使用第二抗体的情况下检测您感兴趣的蛋白质。这为您节省了宝贵的时间，因为您还可以通过使用不同标记的抗体（如AFDye 647和AFDye 488）同时检测同一样本中的不同蛋白质。

PROGEN为B1抗体提供两种不同的AFDye?偶联物：AFDye 647和AFDye 488。

Progen提供各种抗体用于鉴别AAV感染的不同阶段以及rAAV的组装分析。艾美捷科技是PROGEN的经销商，为科研工作者提供优质的产品与服务。