Bst聚合酶,作为一种特殊的DNA聚合酶,因其独特的特性和广泛的应用而备受关注。
基于Bst聚合酶的活性,Saphir-Bst GreenMaster冻干液在恒定温度(60至65°C)下快速、稳健的扩增DNA。该酶显示出高转移置换活性,并产生高达109的扩增因子,这与PCR测定中的约.30个循环相当。Saphir-Bst GreenMaster冻干液允许在10-20分钟内检测目标基因。
艾美捷Bst聚合酶/Saphir Bst GreenMaster冻干粉(PCR-398S)含有Saphir Bst聚合酶、dNTPs(去氧核苷酸三磷酸)、反应缓冲液、绿色DNA嵌入染料、添加剂和稳定剂,以冻干形式提供,用于20微升Z终检测体积的PCR级水。
Bst聚合酶处理方式:
Saphir Bst GreenMaster冻干粉以8管条或96孔板的形式交付,预装有完整的主混合物,以干燥、室温稳定的格式。这种冻干粉结合了高性能与使用的便利性和稳定性。无需进行冷冻、解冻或在冰上移液。剩余的少量移液步骤Z小化了错误或污染的风险。每个小瓶包含进行20微升LAMP(环介导等温扩增)检测所需的所有组分(除了引物和模板)。要执行检测,只需将小瓶用引物混合物填充并加入DNA模板。这种冻干粉还可以与ROX参照染料一起使用,在兼容ROX信号评估的PCR仪器中。在这种情况下,ROX染料(#PCR-351)应以1倍浓度添加到PCR反应中。
检测设计:等温扩增是一种极其敏感的检测方法,应当注意避免实验设置区域和设备与之前反应的DNA发生污染。一个可能出现的问题是,由于携带污染或非特异性退火引物或引物二聚体形成,导致无模板对照中出现扩增。
引物设计:通常,使用4种不同的引物来识别6个不同的DNA区域,允许特定目标基因的扩增。额外一对引物可以进一步加速扩增,将总检测时间缩短至10-20分钟。由于反应序列复杂,手动设计引物可能具有挑战性。为了简化设计过程,建议使用引物设计软件。由于计算机设计的引物在灵敏度和非模板扩增方面可能会有所不同,建议在Z终选择之前评估2-4组真实引物集。
检测设置:使用无菌过滤头进行移液,并在与DNA制备或分析不同的区域进行设置。所有扩增中都应包括无模板对照。首先,准备一个10倍浓度的引物预混合液。其次,设置等温扩增检测:
分配主混合物:将引物/探针混合物彻底振荡(Vortex)以确保均匀性。向每个PCR管或板孔分配20微升(μl)。
? 使用特定的等温扩增检测仪器或实时PCR循环仪来运行检测。
? 将仪器设置为在60至65°C之间的恒定孵化温度(取决于引物退火温度)。
? 以1分钟的间隔测量荧光强度,持续Z多30分钟。
故障排除:
如果在无模板对照中发生扩增,应复查以下要点:
环境的交叉污染:
使用“DNA Away”溶液清洁设备和区域
用新组分替换试剂库存和预混物
在非模板扩增发生之前提前停止反应
来自先前反应产物的携带污染:
扩增后避免打开反如果需要进行反应后处理,请使用单独的准备区域和设备
引物引起的非模板扩增:
逐步将孵化温度提高1-2°C
为靶序列设计一套新的引物
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