Epigentek 染色质研究和ChIP工作流程方案

什么是染色质免疫沉淀 （ChIP）？

研究染色质相关修饰广泛使用的方法之一是染色质免疫沉淀（ChIP），这是目标蛋白质与特定基因组DNA区域结合的过程。这种流行的 ChIP 检测方法为表观遗传学研究人员提供了有关某些蛋白质或蛋白质修饰与特定 DNA 序列之间相互作用的宝贵信息。

蛋白质-DNA相互作用对某些细胞功能至关重要，例如DNA复制和重组，基因转录，染色体分离，信号转导和表观遗传沉默。例如，了解蛋白质-DNA相互作用可用于比较两个不同组（例如患病或健康的组织）中与特定基因启动子区域相关的组蛋白甲基化量。染色质免疫沉淀方法也可用于绘制各种其他组蛋白修饰的基因组位置。

ChIP 是否适合您的实验？

由于染色质免疫沉淀和各种下游应用可能需要时间并带来相关费用，因此值得了解 ChIP 是否适合您的研究。

首先，建议查看与您提议的实验相关的现有文献。有时，其他研究人员已经完成了跑腿工作，为您的研究奠定了坚实的基础，而无需重新发明轮子。从这里开始，您的团队可以采取变化和独特的角度，使研究变得有趣、独特和有价值，同时回顾以前完成的工作，以发现以前的研究人员面临的任何潜在障碍或问题。让别人的经验对你有利，提前从你自己的学习中节省时间和头痛。

最后，研究人员可能已经对您的靶标进行了 ChIP，因此可以节省大量宝贵的时间和精力。可以找到此类信息的一些常见资源包括USCS基因组浏览器，ENCODE项目和NCBI。在进行研究之前，请务必查看这些资源以获取信息，以查看工作是否已经完成。如果还没有，并且您的目标尚未阐明，则进行 ChIP 实验可能是您研究的正确解决方案。

艾美捷代理Epigentek 染色质研究步骤详细信息：

染色质分离

染色质是DNA和蛋白质的组合，将DNA包装成更小的体积以适应细胞，有助于防止DNA损伤，并控制基因表达和DNA复制。染色质样品的适当分离是研究蛋白质-DNA相互作用的重要因素。EpiGentek专有的染色质分离试剂盒使用多种方法确保完整染色质的质量分离，以帮助从哺乳动物或植物细胞和组织中提取染色质。

目录#      名字      描述

P-2001   闪光染色质提取试剂盒   用于从哺乳动物细胞或组织中分离完整的染色质

P-2022   闪色植物染色质提取试剂盒   用于从植物细胞或组织中分离完整的染色质

P-2023   ChromaFlash 染色质分离和剪切套件   用于以简单快速的形式从哺乳动物细胞或组织中分离染色质或 DNA-蛋白质复合物，然后通过超声处理进行剪切步骤

染色质可及性

染色质结构是基因调控的重要决定因素，所涉及的主要因素之一是染色质对转录因子和其他DNA结合蛋白的可及性。一般来说，染色质越浓缩，转录因子和其他DNA结合蛋白就越难进入DNA并执行其任务。DNA越容易获得，周围基因被积极转录的可能性就越大。研究染色质结构的可及性对于提供核小体存在与否的信息特别感兴趣，核小体直接或间接影响一系列其他细胞和代谢过程。

目录#      名字      描述

P-1047   EpiQuik 染色质可及性检测试剂盒   用于染色质定量分析和真染色质或异染色质状态的测定

染色质碎裂

染色质样品的超声能量处理是酶消化方法的一种被广泛接受的替代方案。通过强调超声技术中的更高通量处理和防止样品污染，我们的EpiSonic?超声仪可以轻松集成到现有的实验室工作流程中，并且特别适合与表观遗传学和下一代应用的兼容性。

目录#      名字      描述

EQC-2000   EpiSonic 2000 超声系统   用于下一代测序应用中 DNA 和染色质的多样品剪切

染色质免疫沉淀 （ChIP）

由于蛋白质-DNA相互作用在细胞功能中起着至关重要的作用，因此识别DNA结合蛋白的遗传靶标并了解蛋白质-DNA相互作用的机制对于理解细胞过程至关重要。研究人员研究这些相互作用的工具之一是染色质免疫沉淀或ChIP。与其他方法相比，ChIP 的优势在于该过程允许检测与活细胞中基因特定序列的特定蛋白质结合。EpiGentek 提供一系列检测试剂盒解决方案，帮助您的实验室高效、准确、重复地成功进行基于 ChIP 的实验。

目录#      名字      描述

P-2002   EpiQuik 染色质免疫沉淀 （ChIP） 试剂盒   用于通过微孔板形式从细胞输入样品中特异性免疫沉淀染色质

P-2027   色闪光高灵敏度 ChIP 套件   用于从少量哺乳动物细胞或组织中免疫沉淀染色质 （ChIP）

P-2014   EpiQuik Plant ChIP 套件   用于从植物输入样品中特异性免疫沉淀染色质

PCR/测序 （ChIP-Seq） NGS 分析

NGS（下一代测序）技术更进一步，增加了数据输出量并降低了 ChIP 测序的成本。ChIP-Seq 提供了已经讨论过的染色质免疫沉淀过程与下一代测序方法的组合，为鉴定转录因子和其他蛋白质的全基因组 DNA 结合位点提供了一种有效的方法。ChIP-Seq 提供了在全基因组水平上解析靶蛋白结合位点的特定基因序列的优势。实时定量PCR（RT-qPCR）提供了一种替代方法，通过使用特异性引物的选择性扩增，在精确的位点分析修饰组蛋白和/或其他DNA结合蛋白的结合位点。EpiGentek为PCR和NGS提供各种廉价的解决方案，包括完整的包装试剂盒，可以方便地从少量或困难的样品中构建高质量的DNA文库。

目录#      名字      描述

P-2030   EpiNext ChIP-Seq 高灵敏度套件 （Illumina）   用于从低起始量细胞进行简化的 ChIP 测序 NGS 文库制备

P-1029   EpiQuik 定量 PCR 快速试剂盒   用于 ChIP 的定量实时聚合酶链反应 （PCR） 分析

剪切和运行 / 切割和标签

近年来，已经取得了一些进展，这些发展正在彻底改变研究人员通过称为CUT&RUN的过程进行DNA-蛋白质相互作用分析的方式。代表靶标下的切割和使用Nuclease，开发用于从有限的生物材料中释放捕获的目标蛋白/ DNA复合物，以绘制蛋白质 - DNA相互作用，并显着提高定位分辨率。这个过程允许使用更少的输入材料，同时限制背景信号。作为扩展，cTIP（CUT & Tag In Place）增加了为下一代测序准备文库的步骤，并为ChIP-Seq提供了类似的解决方案，具有前面提到的所有好处。随着研究格局的变化，CUT&RUN和cTIP有望成为越来越流行的DNA-蛋白质相互作用研究方法，因为它们具有广泛的益处。

目录#      名字      描述

P-2028   EpiNext CUT & RUN 快速套件   为了用来自低起始细胞/染色质的蛋白质富集特定的 DNA 复合物，通过 NGS 鉴定或绘制体内蛋白质-DNA 相互作用

P-2032   EpiNext cTIP （CUT&Tag In-Place）-测序试剂盒   用于从低起始细胞/染色质富集蛋白质特异性 DNA 复合物，并使用 Illumina 平台制备 NGS 文库

艾美捷科技是Epigentek的中国代理商，为科研工作者提供优质的产品与服务。