酶在20微升或100微升的瓶中预混合。这允许研究人员在变性和天然条件下,快速去除糖蛋白中的大部分糖链(O-连接的粘液除外)。通过将酶组合成一种易于使用的预混合溶液,研究人员在追求蛋白质去糖基化的过程中节省了时间和金钱。这些酶也可以单独提供,每种酶20微升的小瓶装(KE-DG01),允许研究人员更全面地表征附着在糖蛋白上的糖链,而不是使用我们的酶混合物。
艾美捷QA-Bio-酶促DeGlycoMx试剂盒包含一个20微升的小瓶,其中包含以下溶液中的酶:
PNGase F(脑膜败血黄杆菌)
O-糖苷酶(肺炎链球菌)
神经氨酸酶(尿素杆菌)
β-半乳糖苷酶(肺炎链球菌)
β-N-乙酰氨基葡萄糖苷酶(肺炎链球菌)
其他提供的试剂:
反应缓冲液
变性溶液
Triton X
QA-Bio-酶促DeGlycoMx试剂盒特异性:
Enzymatic DeGlycoMx?试剂盒将从糖蛋白中去除所有N-连接的寡糖和许多O-连接的寡糖。使用酶PNGase F进行N-连接糖链(天冬酰胺连接)的蛋白质去糖基化。此外,所有丝氨酸或苏氨酸连接的(O-连接)Gal-(b1-3)-GalNAc-(a1)以及所有唾液酸替代的Gal-(b1-3)-GalNAc-(a1)将使用神经氨酸酶和O-糖苷酶的组合去除。添加β-半乳糖苷酶和β-N-乙酰氨基葡萄糖苷酶将有助于较大O-连接结构的去糖基化。
QA-Bio-酶促DeGlycoMx试剂盒使用说明:
在1.5毫升管中,将10微升的反应缓冲液与高达50微克的糖蛋白混合在33微升的蒸馏水中。
添加2.5微升的变性溶液。轻轻混合,然后在沸水浴中放置5分钟。在冰上冷却。
添加2.5微升的Triton-X。
添加2微升的DeGlycoMx酶混合物。在37°C下孵化3小时。
注意:变性可以将酶消化的速率提高多达10倍。如果不希望变性,省略步骤2-3,用5微升的蒸馏水添加,并把孵化时间增加到24小时。
文献参考:
Kobata, A. Use of endo- and exoglycosidases for structural studies of glycoconjugates. Anal Biochem 100:1- 14 (1979).
Kim MS, Leahy D. Enzymatic deglycosylation of glycoproteins. Methods Enzymol.533:259-63 (2013).
Magnelli PE, Bielik AM, Guthrie EP. Identification and characterization of protein glycosylation using specific endo- and exoglycosidases. J Vis Exp. Dec 26;(58):e3749 (2011).
Segu ZM, Hussein A, Novotny MV, Mechref Y. Assigning N-glycosylation sites of glycoproteins using LC/MSMS in conjunction with endo-M/exoglycosidase mixture. J Proteome Res. Jul 2;9(7):3598-607 (2010).
Sojar, H. T. and O.P. Bahl. A chemical method for the deglycosylation of proteins. Arch Biochem Biophys 259:52-57 (1987).
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