分子量大小标记(也称为蛋白ladder,DNA ladder或RNA ladder)是一组用于识别电泳过程中凝胶上运行的分子的大致大小的标准品,依据是分子量与通过凝胶基质的迁移速率成反比。因此,当用于凝胶电泳时ladder有效地提供了对比标度,可以估计其他片段的大小(前提是已知ladder的片段大小)。
艾美捷科技作为专业的生命科学领域解决方案供应商,为您推荐Abnova和Norgen Biotek品牌的可用于各种大小范围的凝胶电泳用RNA和DNA ladder。
RNA Ladder:
产品名称及描述 | 货号 | 规格 | 范围 | DNA Ladder图谱 |
dsRNA Marker Easy (双链RNA marker) | R0006 | 125ul | 10 - 1000 bp | |
Small RNA Marker Easy | R0008 | 125ul | 20 - 100 bases | |
RNA Marker Low Easy | R0002 | 125ul | 20 - 500 bases | |
100 b RNA Ladder | 15002 | 50 loads | 100 - 1000 bases | |
1kb RNA Ladder | 15003 | 50 loads | 200 - 4000 bases | |
RNA Marker High Easy | R0004 | 25ug | 200 - 8000 bases |
Tips:
相同的分子量情况下,RNA的迁移速度将比DNA快。 然而,分子量较小的样品能够迁移更大的距离。选择RNA或DNA ladder作为标准品时,应考虑此关系。
在凝胶上运行RNA ladder和RNA样品时,防止核酸酶污染非常重要,因为RNA对核糖核酸酶(RNase)的催化降解非常敏感。与RNA接触的任何玻璃器皿均应使用焦碳酸二乙酯(DEPC)进行预处理,塑料材料应为一次性使用。
DNA Ladder:
产品名称及描述 | 货号 | 规格 | 范围 | DNA Ladder图谱 |
Mini Sizer 50bp DNA Ladder | 11200 | 100 loads | 25 - 650 bp | |
50 bp DNA Ladder | 13525 | 100 loads | 50 - 500 bp | |
PCR Ranger 100bp DNA Ladder | 11300 | 100 loads | 50 - 1000 bp | |
FastRunner DNA Ladder | 12800 | 100 loads | 50 - 2000 bp | |
PCR Sizer 100bp DNA Ladder | 11400 | 100 loads | 100 - 1000 bp | |
LowRanger 100bp DNA Ladder | 11500 | 100 loads | 100 - 2000 bp | |
Clone Sizer 100bp DNA Ladder | 11600 | 100 loads | 100 - 2686 bp | |
FullRanger 100bp DNA Ladder | 11800 | 100 loads | 100 - 5000 bp | |
HighRanger Plus 100bp DNA Ladder | 12000 | 100 loads | 100 - 10000 bp | |
MidRanger 1kb DNA Ladder | 11700 | 100 loads | 300 - 5000 bp | |
HighRanger 1kb DNA Ladder | 11900 | 100 loads | 300 - 10000 bp | |
UltraRanger 1kb DNA Ladder | 12100 | 100 loads | 300 - 24000 bp |
Tips:
与实验样品一样,凝胶的状况会影响与之平行的分子量大小ladder。诸如缓冲液,电荷/电压和凝胶浓度等因素会影响marker/ladder/标准品的流动性和外观。
缓冲液的作用是建立pH和提供离子以支持电导率。在DNA电泳中,TAE(Tris-acetate-EDTA)和TBE(Tris-borate-EDTA)是常用的缓冲液。TBE缓冲液适合用于小的DNA片段,而TAE更适合于大于1500个碱基对的片段。在缓冲能力方面,TAE比TBE较低;这通常会导致DNA的迁移速度变慢。TBE有更好的分辨率。必须注意的是,水不能代替这些缓冲液,DNA不会沿着凝胶迁移。此外,用水代替缓冲液会导致凝胶融化。
就电压而言,建议的范围是4-10 V / cm(即伏特/cm)。琼脂糖凝胶通常在5 V / cm的电压下运行。电压远低于或高于此范围将影响条带的迁移率和分辨率。低压会降低迁移率,并导致条带变宽。高压会降低条带的分辨率,过高的电压会导致凝胶过热甚至熔化。
选择ladder时必须考虑琼脂糖浓度。凝胶百分比影响DNA的迁移。凝胶浓度越高,DNA在凝胶中移动的速度越慢。较小的条带在较高百分比的凝胶上可较好地分辨,而分子量较高的条带在较低百分比的凝胶上更易于观察。
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