5-乙炔基-2'-脱氧尿苷(5-EdU)可以用作5-溴-2'-脱氧尿苷(BrdU)的替代品,用于测量细胞周期S期中的新DNA合成。5-EdU能够穿透细胞,并代替其天然类似物胸腺嘧啶掺入到复制的DNA中。随后,生成的乙炔基功能化的DNA可以通过铜(I)催化的点击化学反应进行检测,这提供了选择引入生物素基团(通过生物素的叠氮化物)用于随后的纯化任务,或引入荧光基团(通过荧光染料的叠氮化物)用于随后的显微成像[1-5]。Presolski等人[6]和Hong等人[7]提供了一个铜(I)催化的点击化学反应的通用协议,这可以作为设置和优化个别测定的起点。
5-乙炔基-2'-脱氧尿苷(5-EdU)的结构式:
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5-乙炔基-2 '-脱氧尿苷(5-EdU) | CLK-N001-100 | 查看 |
5-乙炔基-2 '-脱氧尿苷(5-EdU)参数:
运输:在常温下运输
储存条件:在-20°C下储存
附加储存条件:干燥储存并在惰性气体下
短期暴露(累计最多1周)于常温下是可能的
保质期:自交货日期起12个月
分子式:C11H12N2O5
分子量:252.23 g/mol
精确质量:252.07 g/mol
CAS号:61135-33-9
纯度:≥98%(高效液相色谱法)
形态:固体
颜色:白色至灰白色
溶解性:在DMSO中,室温下可溶解至200 mM浓度;在1 x PBS或水中,通过将得到的悬浮液加热1分钟至70°C也可溶解
光谱特性:Z大吸收峰λmax 288 nm,摩尔吸收系数ε 12.0 L mmol^-1 cm^-1(Tris-HCl pH 7.5)
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文献参考:
[1] Salic et al. (2008) A chemical method for fast and sensitive detection of DNAsynthesis in vivo. Proc. Natl. Acad. Sci. USA 105 (7):2415.
[2] Li et al. (2010) Fluorogenic click reaction for labeling and detection of DNAin proliferating cells. Biotechniques 49 (1):525.
[3] Chehrehasa et al. (2009) EdU, a new thymidine analogue for labellingproliferating cells in the nervous system. J. Neurosci. Methods 177:122.
[4] Limsirichaikul et al. (2009) A rapid non-radioactive technique formeasurement of repair synthesis in primary human fibroblasts byincorporation of ethynyl deoxyuridine (EdU). Nucleic Acids Res. 37 (4):e31.
[5] Buck et al. (2008) Detection of S-phase cell cycle progression using5-ethynyl-2’-deoxyuridine incorporation with click chemistry, an alternative tousing 5-bromo-2’-deoxyuridine antibodies. Biotechniques 44 (7):927.
[6] Presolski et al. (2011) Copper-Catalyzed Azide-Alkyne Click Chemistry forBioconjugation. Current Protocols in Chemical Biology 3:153.
[7] Hong et al. (2011) Analysis and Optimization of Copper-CatalyzedAzide-Alkyne Cycloaddition for Bioconjugation. Angew. Chem. Int. Ed. 48:9879.
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