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Worthington:氨基酸氧化酶,D-:从代谢物测定到生物传感器的开发

发布者:艾美捷科技    发布时间:2024-12-13     
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D-氨基酸氧化酶(DAAO)是一种氧化还原酶,它将D-氨基酸氧化脱氨基为相应的α-酮酸。DAAO是一种黄酶,每单体含有1摩尔FAD。

特异性

D-型脯氨酸、蛋氨酸、异亮氨酸、丙氨酸、缬氨酸和苯丙氨酸是良好的底物(Scannone等人1964年,Dixon和Kleppe 1965b年)。据报道,该酶作用于L-脯氨酸(Wellner和Scannone 1964年)和D-乳酸(Yagi和Ozawa 1964b年)。pkDAOO的最佳底物是D-脯氨酸,而DAAOs对D-天冬氨酸表现出非常低或没有活性(Tishkov和Khoronenkova 2005年)。

 

不同物种的DAAOs一级结构中的底物结合域没有显示出高度同源性。这可能反映了不同来源的DAAOs在特异性上的广泛变化(Tishkov和Khoronenkova 2005年)。

 

组成

活性pkDAAO全酶是一个由347个氨基酸组成的单体,可以发生二聚化。单体比二聚体更具活性,并且每个单体含有1摩尔非共价结合的FAD。截至2000年,所有已表征的DAAOs都含有非共价结合的FAD作为它们的辅助基团(Pilone 2000年)。

 

分子特征

编码哺乳动物DAAO的基因在基因组中只有一个副本。一个1041 bp的开放阅读框架编码了酶的所有347个氨基酸。这表明没有发生由蛋白酶催化的翻译后加工(Fukui 1987年)。

 

猪D-氨基酸氧化酶的一级结构由Ronchi等人(Ronchi等人1982年)确定,基因由Momoi等人(Momoi等人1988年)克隆。在不同来源的DAAOs中,一级结构中有六个区域高度保守(Faotto等人1995年)。区域I包含共识序列GXGXXG,区域I和III已被发现涉及辅酶结合(Wierenga等人1983年)。区域II、IV和V包含活性位点残基。Ser-Lys/His-Leu末端序列是过氧化物酶体靶向信号序列(Subramani 1993年,Pilone 2000年)。

 

哺乳动物DAAOs显示出63%的同一性,而三种已知的微生物DAAOs(R. gracilis、T. variabilis和Fusarium solanii)显示出18%的同一性。酵母和哺乳动物DAAOs之间观察到30%的同一性(Pilone 2000年)。

 

艾美捷Worthington氨基酸氧化酶,D-(9000-88-8)的应用:

酮酸制备

氧化还原研究

从外消旋混合物中分离L-氨基酸

FAD测定

D-丙氨酸测定

生物传感器(Inaba等人2003年)

 

D-氨基酸氧化酶的特性:

CATH分类

类别:Alpha Beta

架构:2层三明治和3层(aba)三明治

拓扑:D-氨基酸氧化酶;链A,第2个结构域和Rossmann折叠

分子量:78.7 kDa(理论)

单体:38.0-39.0 kDa(Curti等人1973年,Tu等人1973年)

最佳pH值:

取决于底物:D-丙氨酸约为9(Dixon和Kleppe 1965c年)。

 

等电点:7.0,7.2(Tishkov和Khoronenkova 2005年)

 

消光系数:

75,420 cm-1 M-1(理论)

E1%,280 = 19.17(理论)

活性位点残基:

酪氨酸(Y224)

天冬氨酸(D228)

精氨酸(R283)

(Pilone 2000年)

抑制剂:

2-羟酸,2-酮酸和2-氧丁酸(Dixon 1965b年)

代谢产物和药物(Hamilton和Buckthal 1982年)

腺苷5'-单磷酸和苯胺(Yagi等人1972c年)

苯甲酸(Pollegioni等人2007年)

苯甲酸钠(Nguyen等人2009年)

 

文献参考:

Aki, K. , Tagagi, T. , Isemura, T. and Yamano, T.

Optical Rotatory Dispersion and Circular Dichroism of D-Amino Acid Oxidase , Biochim Biophys Acta 122 , 193 , 1966

 

Alston, T. , Porter, D. and Bright, H.

Suicide Inactivation of D-Amino Acid Oxidase by 1-Chloro-1-Nitroethane , J Biol Chem 258 , 1136 , 1983

 

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