在体内富集组蛋白或转录因子（TF）结合的DNA，随后进行qPCR和/或下一代测序，为研究全基因组蛋白质-DNA相互作用提供了一个有利的工具。通常用于实现这一目标的主要方法是免疫沉淀后测序（ChIP-seq）。这种方法包括高度特异的ChIP-exo和ChIP-nexus。这两种实验提供高分辨率的映射。然而，这些实验的主要局限性在于它们需要大量的输入材料、细胞或组织，以产生足够强的信号，超过背景噪音。CUT&RUN（靶向裂解和核酸酶释放）是为了使用有限的生物材料对蛋白质-DNA相互作用进行映射而开发的，它需要更少的样品量，同时显著提高了映射分辨率。然而，这种实验的一个相当大的缺点是抗体未耦合pAG-MNase的非特异性裂解，显著限制了CUT&RUN在不同物种和细胞/组织类型中大多数转录因子的特异性使用。此外，原始CUT&RUN步骤繁琐，需要优化实验条件，仍然耗时。
整合ChIP和CUT&RUN的所有优势，克服其缺点，EpiNext? CUT&LUNCH（靶向裂解并均匀解放独特核酸复合物）检测试剂盒可以在创纪录的时间内实现对目标蛋白质/DNA复合物的高度特异富集。
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为什么要花费数天时间进行传统的CUT&RUN或ChIP实验，当你可以在不牺牲性能的情况下更快地实现蛋白质/DNA富集呢？使用EpigenTek的新CUT&LUNCH套件，你可以在仅一个早晨的实验中迅速富集目标蛋白质/DNA复合物。
快速方案：在不到2小时内完成实验。
低非特异性背景：仅有3-5%的非特异性DNA结合。
高特异性和分辨率：DNA在富集目标蛋白质区域的两端被选择性地切割。
具有成本效益：与传统的CUT&RUN实验相比，每次反应的价格几乎是一半。
无需特殊软件：使用现有经过时间考验的ChIP-seq生物信息学流程来进行NGS数据分析。
不要让冗长的实验步骤耽误你的一天。选择CUT&LUNCH，获得高效、高质量的结果，符合你的时间表和预算。富集你的蛋白质/DNA复合物，重新拥有你的午餐时间！
| 产品名称 | 货号 | 规格 |
EpiNext CUT&LUNCH 检测试剂盒 EpiNext CUT&LUNCH Assay Kit | P-2035-24 | 24 Reactions |
EpiNext CUT&LUNCH 检测试剂盒包含了富集特定蛋白质（组蛋白或强结合转录因子）特异性DNA复合物所需的所有必要试剂，以通过qPCR或NGS从各种细胞样品中分析蛋白质和DNA之间的相互作用。在这个实验中，细胞被渗透化并暴露在感兴趣的ChIP级抗体中。通过使用独特的核酸裂解酶混合物，靶向染色质区域两端的DNA序列被切除。被释放的非特异性蛋白质-DNA复合物被消除，只有结合抗体的复合物将被选择性地回收。被捕获的蛋白质/DNA复合物中的DNA片段被纯化，并可以直接用于基因特异性qPCR或DNA文库构建，以分析蛋白质和DNA之间的相互作用。
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| CUT&LUNCH | 传统 CUT&RUN | 芯片 | |
| 工作流程方便程度 | 方便 总共只需 19 个步骤 | 不太方便 >总共 50 步 | 因不同的 ChIP 检测而异 |
| 所需细胞数量 | 2,000 - 500,000 | 5,000 - 500,000 | 100 - 10,000,000 |
| 分析目标范围 | 适用于组蛋白 适用于TF蛋白 | 适用于组蛋白 不适用于TF蛋白 | 适用于组蛋白 适用于TF蛋白 |
| 裂解和收集的 DNA 的特异性 |
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| 不适用 |
| 序列分辨率 | 高 | 高 | 中等 |
| 负/阳性对照率 （%） | 5% | 30% | 20% |
| 检测时间长度 | 1 小时 50 分钟 | 6 小时 - 2 天 | 对于不同的 ChIP 检测，从 4 小时 - 2 天不等 |
| 每次检测反应的价格 | 低 | 高 | 不同 |
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